♦ вычислительная математика и математическое моделирование;
♦ кинетические свойства редкоземельных металлов и их сплавов;
♦ фильтрационные процессы в многозонных массивах со сложными геологическими условиями;
♦ философское осмысление действительности: проблемы и методология исследования;
♦ методологические и социологические проблемы межнациональных отношений;
♦ актуальные проблемы рыночных отношений;
♦ история и культура народов Северного Кавказа;
♦ проблемы теории, истории и типологии кавказских и тюркских языков;
♦ проблема межъязыковых контактов в Карачаево-Черкесии;
♦ закономерности и особенности развития многонациональной литературы;
♦ проблемы становления и развития периодической печати на языках народов Карачаево-Черкесии;
♦ этнопедагогика и этнопсихология народов Северного Кавказа;
♦ культурологический подход в реализации региональный-национального компонента образования в вузе;
♦ сравнительная педагогика и проблемы образования в современном мире;
♦ проблемы совершенствования подготовки художников-педагогов;
♦ изобразительное и декоративно-прикладное искусство народов Северного Кавказа: история, теория, педагогическая практика;
♦ теоретико-методологические проблемы совершенствования системы подготовки учителя физической культуры;
♦ учебно-методическое обеспечение подготовки учителя родного (абазинского, карачаево-балкарского, кабардино-черкесского и ногайского) языков и литератур;
♦ основы рационального использования природных ресурсов Карачаево-Черкесии (высокогорная флора и фауна Северо-Западного Кавказа);
♦ рациональное природопользование на эколого-экономической основе в условиях горных и предгорных ландшафтов.
Сотрудники университета участвуют в различных конкурсах на проведение работ в рамках целевых и научно-технических программ, грантах.
В университете ведется целенаправленная работа по подготовке научно-педагогических кадров через аспирантуру, действует диссертационный совет по защите докторских и кандидатских диссертаций по историческим наукам.
Карачаево-Черкесский государственный университет расширяет научно-техническое сотрудничество с другими вузами региона. В рамках КЧГУ функционируют научно-исследовательская лаборатория геоэкологического мониторинга, Центр этнографических и археологических исследований, Центр развития педагогического образования, Центр исследования языков народов Карачаево-Черкесской Республики, Центр абазинской культуры и языка, Центр ногайской культуры и языка, Центр карачаевской культуры и языка, Центр черкесской культуры и языка, Центр по продвижению русского языка и казачьей культуры.Выпускаются журналы
1. Научные:«Вестник»,« Материалы и исследования по археологии Северного Кавказа»,
2. Литературно-художественные и научно-просветительские: «Тау аязы »(«Горный ветер»),«Хэку»(«Отчизна»),
«Абазашта адзыхьква» («Родники Абазашты»),«Саьвле» («Луч»)
Ежегодно издаются сборники научных трудов, материалы научных конференций.
Алиевские чтения-2024 Информационное письмо
Алиевские чтения- 2023 Информационное письмо
Алиевские чтения-2022 Информационное письмо
Алиевские чтения – 2021 Информационное письмо
Алиевские чтения-2023. Программа научной сессии преподавателей и обучающихся, 17-22 апреля 2023 г.
Алиевские чтения-2022. Программа научной сессии преподавателей и обучающихся, 25-30 апреля 2022 г.
Алиевские чтения -2021. Программа научной сессии преподавателей и обучающихся, 26-30 апреля 2021 г.